藏毛窦一般需要手术治疗，为了减少并发症，手术方式一般会根据囊肿和窦道的数量、分布以及有没有并发感染来决定。如果术前就并发感染，应该先做抗感染治疗，包括全身用药和局部的窦道冲洗。肛周和会阴部皮肤的毛发，一般都会存有大量细菌，同时细菌可以通过切开、穿刺以及其它任何破坏皮肤屏障的损伤进入组织内导致感染。术后是否感染及其演变，一般取决于患者抵抗力、细菌毒力和治疗方法等各种因素。由于手术部位、手术性质以及感染出现的时间和程度不同，可以表现为创面局部的感染和全身感染，两种可以单独存在，也可以同时存在。局部感染的表现一般是局部的红肿、疼痛、水肿，口表面可以看到脓性分泌物，同时局部会有烧灼感。严重的病人，会有局部感染症状和全身症状，包括发热、头痛、乏力、食欲减退、脉率加快的表现。如果术后有脓肿形成，应该在早期及时的切开排脓。引流不通畅的，需要充分引流，必要的时候可能需要敞开、扩创。细菌一般不会在干燥的环境中生长和繁殖，所以可以适当的用红外线烤灯烘烤创面，控制创面感染，同时加强护理，彻底换药，将分泌物清除干净，同时防止大小便污染。日常生活的时候，采取俯卧位或者侧卧位，避免骶尾部的手术部位受压。