HPV病毒感染的治疗目前没有一种药是特效的，也就是说没有一种药物能够彻底的清除HPV病毒感染，口服药更是没有这样的药物。常使用的治疗HPV的药物，常常是干扰素的阴道局部的凝胶。干扰素有不同的剂型，它有一定的清除HPV病毒的作用，可以干扰HPV病毒的合成，来起到抑制病毒的作用。但是它的效果仍然不是非常确切的，并且不能从根本上来清除HPV病毒。 另外就是HPV病毒它有一定的自愈的机会，也就是说当患者比较年轻，机体抵抗力比较强的时候，绝大多数的女性都可能会通过自身的抵抗力，来将病毒自动清除。这个自动清除的时间一般都是在八个月到一年左右，所以如果是单纯的HPV感染，而没有导致宫颈病变、宫颈癌以及外阴、阴道、肛门周围的尖锐湿疣的这样疾病的情况下，可以给它一个时间，来让病毒有一个自行清除的机会。在这个等待的机会中，可以通过锻炼身体，增强机体的抵抗力，多吃一些高蛋白的食物，并且使用一些干扰素的凝胶来协助帮助病毒清除。