脑梗死的二级预防又称临床前期的预防。二级预防的目标人群是发生过一次或多次脑卒中的患者，针对其发病的病因来控制可干预的危险因素，以此预防和降低卒中的再发风险。二级预防主要是通过早期发现、早期诊断，防止疾病在临床前期或临床初期的恶化，而二级预防的规范治疗是能够显著降低卒中的复发风险。脑梗死的二级预防的药物选择常根据其病因分析。若患者为大动脉粥样硬化型，需使用抗血小板药物，如阿司匹林、氯吡格雷。若患者为心源性脑栓塞型，则需使用抗凝药物，如华法林、新型的达比加群、利伐沙班等。另外，较多动脉粥样硬化的患者需使用调脂药物，如他汀类的药物，以此来稳定动脉斑块。如果患者合并有高血压、糖尿病，则需使用降压药、降糖药。二级预防的药物需坚持用药，提高用药的依从性，以此降低卒中复发的风险。