支原体感染与细菌感染的区别包括以下几点：1、病原微生物：细菌感染的致病菌主要为大肠杆菌、金黄色葡萄球菌或者变形杆菌，而支原体感染的致病菌为支原体；2、查体：支原体感染通常称为非淋菌性尿道炎，尿道外口出现大量稀薄分泌物，分泌物无明显异味感，鉴定可发现支原体，而细菌感染尿道外口分泌物呈脓性；3、症状：支原体感染尿道外口瘙痒感较重，为病人就诊的主要原因。细菌感染常表现为尿频、尿急、尿痛，尿道外口感觉较弱或仅表现为排尿时烧灼感。