先天性足部畸形可以由很多因素造成，可以是来自于脑部，比如由脑瘫形成的足部畸形，或来自于神经系统，比如脑脊膜膨出，或其它病变形成足部畸形。也可以是本身先天发育，比如多趾畸形或骨不连等畸形，都可以造成足部畸形或缺趾等。 脑部神经系统和先天发育不足引起的畸形，可以形成多种多样的足部畸形，比如内外翻畸形，或多趾、缺趾畸形，或造成足弓改变，或骨结构的改变，甚至双脚大小发育不同，以上因素都可以形成先天性足部畸形发生。