龟头有时候一阵一阵疼，应根据原因进行选择药物，包括疱疹病毒感染、溃疡性龟头炎、梅毒感染等，具体如下：1、疱疹病毒感染：龟头疱疹病毒感染引起龟头表面破损、糜烂，可以口服阿昔洛韦治疗，对单纯疱疹病毒感染引起的龟头疱疹病毒感染有较好疗效；2、溃疡性龟头炎：如溃疡性龟头炎引起的一阵一阵疼，可以口服盐酸米诺环素治疗，对溃疡性龟头炎有较好的疗效。还可以口服盐酸多西环素治疗，对浅表性龟头炎、溃疡性龟头炎引起龟头疼痛症状有较好的治疗效果；3、梅毒感染：梅毒感染引起的溃疡，导致龟头一阵一阵疼，需要肌注长效青霉素治疗，龟头硬下疳引起的疼痛症状会明显好转。还可以口服盐酸克拉霉素治疗，对多种致病菌、龟头疼痛症状都有较好疗效，还可以外用药物治疗。