肠镜后肛门疼的情况很少出现，需分析具体情况以及具体原因。首先做肠镜之前肛门疼不疼，如果做之前就疼，可能跟原发疾病有关。其次如果做之前不疼，做完之后疼，一般是患者在做之前就有痔疮或肛裂，若反复内镜进出，有可能会诱发患者疾病发生。肠镜检查之后可能会出现肛门疼痛，甚至有些患者会出现少量便血。如果没有明显的肠道损伤，在这种情况下，与平时出血疼痛的处理一样，保持肛门周围的清洁，保持饮食清淡，几天后会自行慢慢缓解。