如果IgA肾病患者尿液中出现大量的蛋白尿，也就是表现为肾病综合征的水平，蛋白尿＞3.5g/24h。同时血中的蛋白质很可能出现了降低，即白蛋白低于30g/L，出现了水肿或者高脂血症的情况。这个时候的治疗，要按照肾病综合征的治疗原则进行治疗，应用糖皮质激素进行治疗。首选的就是泼尼松或者甲基泼尼松龙，剂量就是每公斤体重每天1mg。按照肾病的综合征的治疗原则，起始量要足、减量要缓、用药时间要长。同时应用钙剂，防止骨质疏松或者钙质的流失。同时服用血管紧张素转换酶抑制剂或者血管紧张素受体拮抗剂进行降低蛋白尿的治疗或者降低血压的治疗，并且配合百令胶囊、肾炎康复片或者金水宝片进行治疗。IgA肾病绝大多数应用一种免疫抑制剂，效果可能不理想。特别是对于大量蛋白尿的患者，需要联合应用另外一种免疫抑制剂，最常用的就是吗替麦考酚酯，可以配合免疫抑制剂中的糖皮质激素来进行降低蛋白尿治疗，以减少尿液中的蛋白质。使疾病得到良好的恢复，提高血中的白蛋白水平，减轻水肿，降低血脂的水平。