男性尿道口疼痛，主要原因如下：1、炎症疼痛：如果尿道口有炎症、分泌物，可能会出现尿道口疼痛，尤其在排尿或者不排尿时，均可能出现疼痛。此外，前列腺炎症也会出现尿道口疼痛，会放射、牵扯到此处疼痛；2、神经牵扯疼痛：比如输尿管结石牵扯尿道口疼痛，腰椎间盘突出压迫住神经，也会出现疼痛，即神经受压引起的疼痛，此类疼痛局部没有明显表现，只是神经牵涉引起的疼痛；3、局部刺激疼痛：包括尿道结石、肌肉、肿物引起局部疼痛，即局部异物刺激引起尿道口疼痛。所以根据每一种原因引起的疼痛，选择不同方法检测，明确尿道口疼痛原因，再提出更加科学、准确、对症的治疗疼痛方法。