同房后尿道口疼痛的原因是尿道炎、系带较短、前列腺炎、后尿道结石等，具体如下：1、尿道炎：同房后尿道口疼痛最常见于尿道炎。病人在同房时发生细菌感染，导致尿道口出现炎性反应，出现尿道口发红和疼痛症状；2、系带较短：系带较短的病人在性生活时由于系带撕裂，也会导致尿道口附近出现红肿、疼痛的症状，部分病人还会出现尿道口局部出血的症状；3、前列腺炎：特别是淋菌性前列腺炎，主要是由淋菌性尿道炎逆行感染所致。病人发生淋菌性前列腺炎时，淋菌感染导致前列腺部尿道黏膜出现红肿、糜烂。同时尿道口舟状窝处出现溃疡性改变，性生活时出现尿道口疼痛；4、后尿道结石：后尿道结石的病人由于结石嵌顿在后尿道，引起尿道放散性疼痛，同房后会出现尿道口流血和疼痛。病人出现上述症状时，应及时到泌尿外科或男科就医。