一侧扁桃体疼痛时，有以下几种情况：1、扁桃体发炎：扁桃体一侧疼痛，可能是扁桃体发炎引起扁桃体周围出现炎症；2、扁桃体周围脓肿：扁桃体出现炎症时，由于药物控制不及时或由于身体抵抗力比较弱。此时扁桃体炎症没有完全控制住，可以导致一侧的扁桃体周围出现脓肿，可出现一侧扁桃体的疼痛；3、茎突过长：因为茎突位于扁桃体窝，是一个骨头。若茎突过长，如超过3公分，则可出现扁桃体一侧疼痛。因此，若出现扁桃体一侧疼痛，需要检查扁桃腺(扁桃体)是否有炎症。若有扁桃体出现周围炎或扁桃体的周围脓肿，则需尽早用抗生素，若出现扁桃体周围脓肿，还需尽快切开引流，将脓液引流出来。此外，若扁桃体没有炎症，此时还需要做一个CT检查，检查是否存在茎突过长。若存在茎突过长，则需通过手术的方法将茎突切除，切除后扁桃体一侧疼痛的症状会得到缓解。