新生儿呼吸窘迫综合征属于新生儿的危重症，如果早期发现、早期治疗，其预后较佳。因为目前临床上治疗新生儿呼吸窘迫综合征的技术均较为成熟，其治疗的关键在于早期识别。如果新生儿呼吸窘迫综合征于早期识别，并给予呼吸支持与肺泡表面活性物质的替代治疗，一般患儿出生72小时之后，其症状均会逐渐缓解。除非患儿伴有基因缺陷等特殊情况，比如患儿体内产生肺泡表面活性物质的基因出现问题，导致自身不能产生肺泡表面活性物质，所以需要终身进行替代治疗，但终身进行替代治疗在临床上并不现实，因为替代治疗的药物价格均非常昂贵，此类先天伴有基因问题的患儿，其预后一般不佳。如果新生儿呼吸窘迫综合征的发现时间较晚，或者发现新生儿呼吸窘迫综合征之后，无较为有效的治疗技术进行支撑，则患儿可出现顽固的、持续的低氧血症，并会造成各个脏器功能的损伤，甚至衰竭，此类患儿的预后往往不佳。对于临床医生而言，大部分新生儿呼吸窘迫综合征如果能够得到早期的识别、诊断、治疗，其预后较佳。目前预防新生儿呼吸窘迫综合征的较佳措施，即发现孕妇有早产的可能时，应于婴幼儿出生前在产科对孕妇应用激素治疗，应用激素治疗之后，一般婴幼儿在出生后出现急性呼吸窘迫综合征较为少见。