男生阴茎上长小肉粒，在临床上主要考虑以下两大类疾病：1、尖锐湿疣：这是性传播疾病，是由HPV感染导致。这一类男生通常有不洁的性接触或者性伴侣众多，在阴茎、龟头、冠状沟、尿道外口，甚至在肛周有小的菜花样肿物，可以做HPV的快速鉴定。如果明确诊断了以后，就按照尖锐湿疣来进行治疗。一般是根据疣的大小治疗，大部分都可以用激光、冷冻，甚至局麻下手术的办法来予以切除，切除之后，再在创面上涂抹5-FU软膏(5-氟尿嘧啶软膏)，这样就会减少继续复发的可能。在治愈之后，建议男生一定要洁身自好，否则这一类的尖锐湿疣非常容易复发。如果有可能，建议男生的性伴侣也到医院做检查，否则容易发生交叉传染，造成疾病反复复发；2、毛囊炎：在男生的阴茎、阴囊等生殖器官分布着很多的汗腺，这些毛囊一旦感染，局部可能会出现红肿、疼痛的现象，一般考虑是在毛囊的局部细菌感染导致。所以推荐使用百多邦(莫匹罗星软膏)、红霉素软膏等进行外抹治疗。