阴囊长小肉粒的原因具体如下：1、毛囊炎或者皮脂腺炎：这种感染一般是阴囊表面常见的细菌感染导致，如大肠杆菌、葡萄球菌，由于是细菌导致的皮肤浅表感染，所以治疗首选能够外用的抗生素软膏，比如红霉素软膏、百多邦软膏(莫匹沙星软膏)。如果阴囊表面瘙痒感比较重，可以使用炉甘石洗剂，能够显著止痒；2、尖锐湿疣：是性传播疾病，患者一般有不洁的性接触病史，在做检查的时候，发现这些小肉粒某些会长得像菜花一样，这是由于HPV感染所致，可以先做尖锐湿疣的快速鉴定。明确诊断以后，如果肉粒很小，可以首选采用激光或冷冻的方法进行切除，切除之后，表面再涂上5-FU软膏(氟尿嘧啶软膏)，患者基本就可以康复，日后也要注意洁身自好，否则还是容易复发。