大多数情况下，婴儿服用脑蛋白水解物并没有副作用。但由于脑蛋白水解物是从猪的脑蛋白中提取的一种肽制剂，属于异种蛋白，可能会导致少数孩子出现不良反应，具体如下：1、兴奋性症状：例如易激惹、哭闹加重、入睡困难等临床症状；2、全身症状：如血压异常、震颤、表情淡漠；3、胃肠道症状：可能会出现恶心、呕吐、腹痛、腹胀、腹泻等不良反应；4、皮肤异常症状：如皮肤的灼烧感或皮肤瘙痒，或出现过敏性皮炎、荨麻疹等症状；5、发热症状：此外如果是注射脑蛋白水解物，在注射过程中少数孩子可能会出现发热等临床不适症状。