小手指肿痛的原因有多方面，要及时到医院请专科医生进行诊治，做相关检查才能明确诊断，常见原因如下：1、类风湿关节炎：类风湿关节炎常发生在手指，而手指肿痛以及晨僵是常见表现，需要进一步检查类风湿因子、类风湿相关自身抗体、血沉、C反蛋白等；2、痛风：虽然痛风常发生在大脚趾以及掌指关节或者近指关节、腕关节，但在小指也可以出现，关键是血尿酸含量高、手指肿痛红肿，且疼痛剧烈，以夜间发作为主；3、其他疾病：如肢端红斑症、外伤、扭伤，脊柱关节炎表现在外周肢体时或者反应性关节炎反应在外周关节炎时，以及骨性关节炎反映在小手指。