咽喉长期疼痛的原因如下：1、炎症：如慢性咽喉炎或者慢性扁桃体炎等，都可能会引起病人长期有咽喉疼痛；2、舌咽神经痛以及茎突过长：二者也可以引起病人一侧咽喉疼痛；3、肿瘤：如扁桃体癌、淋巴瘤以及喉癌、下咽癌等，这些肿瘤会引起病人长期的咽喉疼痛。所以有了长期咽喉疼痛，一定要到医院就诊，通过喉镜、电子喉镜检查以及影像学检查，通常能够明确病因。如果是由于慢性咽喉炎或者慢性扁桃体炎等引起的咽喉疼痛，可以给予含片、漱口水以及治疗咽喉炎的中成药进行治疗。如果是舌咽神经痛，也可以用药物进行对症治疗。如果由于茎突过长引起长期咽喉的疼痛，可以进行手术治疗。如果是由于恶性肿瘤引起的咽喉长期疼痛要早期诊断，早期进行手术、放疗、化疗以及免疫治疗等综合治疗。