咽喉右侧疼痛，主要原因包括咽炎、扁桃体疾病、一侧茎突过长、下咽部肿瘤，具体如下：1、咽炎：可造成一侧咽部黏膜充血肿胀、侧淋巴索肿胀，从而引起疼痛，治疗主要使用口服抗生素、局部雾化吸入、口含片、漱口液等；2、扁桃体疾病：一侧扁桃体炎、扁周炎、扁桃体良性、恶性肿瘤，均可导致一侧咽喉部疼痛，应及时就诊，查明原因，对扁桃体病变进行处理；3、一侧茎突过长：也可以造成一侧咽部不适、异物感、疼痛、吞咽障碍，应进行影像学检查，判断茎突长短，采取手术或者保守治疗；4、下咽部肿瘤：包括良性和恶性肿瘤，尤其是下咽癌，也可引起吞咽疼痛、吞咽不适，甚至造成声音嘶哑、一侧耳痛。