做肠镜全麻对身体的副作用具体如下：1、呼吸抑制：做肠镜全麻要进行镇痛和镇静，但是会保留自主呼吸，所以病人没有意识，主要影响的是，如果患者比较胖，有时可能会引起呼吸抑制，这时要多注意，可能有这样的异常情况发生，这时要继续给患者吸氧、扣面罩，继续给患者放开通气道，保证患者的呼吸道通畅；2、喉痉挛和喉水肿：部分患者可能对于全麻药比较敏感，可能会引起麻药的不良反应，可能会有喉痉挛、喉水肿的情况，可能要及时处理；3、心率和血压变化：可能会造成小心血管的异常，这时要进行相应的处理；4、造成出血：做肠镜的时候，如果病人服用过阿司匹林的抗凝剂，如果摘除息肉，可能会造成出血，这时要多加注意，防止出血的发生。