细菌性心内膜炎抽血培养时，一般是抽20ml的血分装在两个培养瓶中，一瓶是10ml的血液。对于细菌性的心内膜炎抽血培养，一般至少抽2-3次，根据血培养的结果，选择敏感血培养结果选择敏感的抗生素。对于诊断细菌性心内膜炎，除有发热、血培养结果以外，可能还需要根据超声结果，一般也是诊断细菌性心内膜炎的主要手段，观察瓣膜上是否有赘生物的存在。​如果有赘生物可能就高度怀疑是细菌性心内膜炎，再根据其它临床表现，如发热及部分栓塞的表现，可能更进一步证实心内膜炎诊断，也要根据血培养结果选择敏感抗生素。对于抗生素的应用也需要足量、足疗程，在抗生素应用的情况下效果不好，也可以选择外科手术治疗，清除感染病灶，才能有效控制疾病发展。