同房后第二天小腹疼痛的常见原因如下：1、子宫内膜异位症：女性患有盆腔子宫内膜异位症，是常见引起性交后疼痛的原因。盆腔子宫内膜异位症，在生育年龄女性较为常见，指子宫内膜异位病灶种植在双侧输卵管、卵巢、盆腔腹膜、子宫骶骨韧带、直肠前壁等部位。在同房后，由于同房时导致盆腔充血状态，引起子宫内膜异位病灶充血水肿，从而压迫临近神经引起疼痛症状，尤其表现为下腹部疼痛、腰骶部疼痛或肛门坠胀感。子宫内膜异位病灶会种植在各个部位引起不同症状，可通过妇科双合诊或三合诊检查，并结合妇科超声检查进行全面评估；2、盆腔慢性炎症：引起同房后腹痛症状，还有可能与盆腔慢性炎症有关。女性在患有急性盆腔炎未得到及时彻底治疗情况下，导致炎症迁延不愈，继而引起慢性盆腔疼痛。尤其在同房之后盆腔充血状态，导致慢性盆腔炎症出现有局部下腹部疼痛的症状，可通过全面妇科检查、双合诊检查进行诊断。