当体内存在结核菌时，根据情况不同，处理方式也不尽相同，具体如下：1、免疫功能正常：可在一定时间内将入侵人体的结核杆菌控制，继而消灭。所以在可以通过自身免疫反应去除结核杆菌时，不需要口服抗结核的药物；2、免疫功能低下：结核杆菌大量繁殖会导致患者出现相应的临床症状，如低热、乏力，侵入肺部将导致咳嗽、咳痰，侵入肠道将导致腹痛、腹泻，侵入肾脏将导致便血、尿频、尿急，侵入骨骼将导致患者出现疼痛等。此时应立即进行诊断与治疗，积极使用药物控制病情；3、其他情况：当人体免疫功能不足以完全去除存在于体内的结核杆菌，但患者并未出现临床症状时，即出现共存状态时，建议使用药物进行治疗，积极去除结核杆菌，从而保证身体的健康。