肩胛骨困疼的常见原因包括肩周炎、肩峰下撞击综合征以及肌肉劳损等，具体情况如下：1、肩周炎：患者发生肩周炎症可引起肩胛骨困疼并伴有活动受限，通过体格检查能够进一步确认；2、肩峰下撞击综合征：肩峰与肱骨大结节的撞击可以造成肩峰下炎症，炎症因子释放会形成继发性的肩周炎，患者会有肩胛骨困疼、肩关节活动受限、无力等临床表现。通过肩关节正位片、Y位片以及肩关节核磁共振检查，能够进一步确认；3、肌肉劳损：如果患者从事重体劳动或者运动过量，可以造成肩胛骨周围肌肉劳损，肌肉会持续紧张、痉挛固定肩胛骨，造成肩胛骨困疼症状。通过手法按摩、热敷等治疗，可以使症状得到减轻。综上所述，肩胛骨困疼患者首先应该到骨科门诊就诊，由专科医生进行详细的检查。确诊病因后，根据病因选择合适的治疗方法进行处理，尽快缓解症状。