肛门疾病可以就诊的科室如下：1、结直肠肛门外科门诊；2、如果医院没有结直肠肛门外科门诊，可以挂结直肠外科门诊；3、如果没有结直肠外科门诊、结直肠肛门外科门诊，应该挂肛肠外科门诊；4、部分医院没有结直肠肛门外科门诊、结直肠外科、肛肠外科，可以挂胃肠外科门诊；5、如果是小医院，如县医院、基层医院，分科不详细，没有胃肠外科、结直肠外科、肛肠外科，此时可以挂普通外科。如果没有普通外科，则应该挂外科门诊。如果患者所去的医院没有上述科室，建议到上一级医院就诊，因为肛门疾病不可以在内科就诊，需要优先选择结直肠肛门外科门诊和肛肠外科门诊。