放射性颌骨骨髓炎和常规颌骨骨髓炎有所区别，一般的颌骨骨髓炎由炎症引起，所以在病理上经常可看到炎症细胞引起的炎症性反应变化、脓灶以及毛细血管增生炎症反应。而放射性颌骨骨髓炎一般由过剂量的放射性物质所引起，此时主要表现为颌骨坏死，而不是炎症性的反应。通常情况下，在显微镜下可看到小块坏死性的骨组织，骨细胞不清晰，替代正常骨细胞的为坏死组织。同时，因为放射性颌骨骨髓炎并不是炎症性疾病，所以不能够看到炎症性反应，比如淋巴细胞、浆细胞浸润和脓灶细胞的形成，以上均没有，而是单纯由坏死骨组织和周围没有看到的骨细胞、成骨细胞引起，此为放射性颌骨骨髓炎和常规的骨髓炎不同之处。