少数甲状腺功能减退属于一过性，一般不会遗留较长时间。最常见亚急性甲状腺炎引起的甲状腺功能减退，治疗后基本可以彻底治愈，无需长期用药。大多数甲状腺功能减退以后较难完全治好，尤其自身免疫性甲状腺炎导致的甲状腺功能减退，还包括手术操作不当导致甲状腺功能减退，例如甲状腺手术时甲状腺组织切除过多。 甲亢患者在碘-131治疗时所引起的甲状腺功能减退无法彻底治愈，因为甲状腺组织被破坏以后功能无法完全恢复。只能通过终身服用甲状腺激素补充，使机体甲状腺功能维持正常范围，但通常不会影响日常生活。