当阴道内的菌群平衡被破坏时，就是指微生态失衡。人类本身并不绝对无菌，在女性口腔、肠道、阴道内都有很多种细菌在相互平衡、相互依赖、相互制约中共同生存。举个例子，女性的阴道内有很多种不同的细菌存在，这里面有一些能够起到阴道卫士的很好的细菌，如阴道乳杆菌等，也有一些可能会致病的如加德纳菌等这类厌氧菌，以及假丝酵母菌等这类真菌，当阴道内的菌群平衡被破坏时，就是微生态失衡。譬如女性在罹患糖尿病的时候，就容易导致阴道内的菌群破坏，如果在近期应用了很多广谱抗生素，同样也容易导致微生态的失衡，另外进行频繁的性生活、性刺激，也容易导致阴道内环境发生紊乱，造成微生态失衡。当女性阴道内的微生态失衡，就容易导致原有的厌氧菌，或者是假丝酵母菌出现异常的增殖，如果这些厌氧菌异常增殖，将会导致细菌性阴道病，这时女性就会出现外阴阴道瘙痒不适的症状，还会出现很明显的阴道分泌物的腥臭味。如果是有假丝酵母菌的异常增殖，而且转变成菌丝相，将会具备着侵蚀能力，进而就能够让女性出现外阴阴道的皮肤黏膜的红肿，以及瘙痒和灼痛，而且还会带来很多的豆腐渣状或者是凝乳状的白带。由此可见，女性的阴道内如果微生态失衡，将会大大增加阴道炎症的发生。而在治疗的时候，一方面要杀灭致病的病原体，另外一方面也要积极恢复阴道内的菌群平衡的状态，这时才能减少以及避免未来的阴道炎反复发作。