小腹连着肛门疼痛的原因包括以下几方面：1、直肠病变：常见于溃疡性直肠炎或直肠炎等，这时表现为肛门口可能疼痛，小肚子也会疼痛，除了疼痛之外，还可能出现黏液脓血便，1天可能解4-5次稀便，同时伴有黏液；2、肠道肿瘤：小腹连着肛门疼痛的疾病，还可能包括直肠下段的肿瘤或直肠癌，可能由于局部刺激直肠壁，引起牵涉性内脏疼痛，也会引起小腹连着肛门疼痛的表现；3、肛门、肛管病变：如果出现肛门、肛管病变，也可能导致上述症状，肛管病变可能常见于肛裂或痔疮、肛周脓肿等，严重时会引起小腹疼痛，但一般情况下不会引起上述症状，只是肛门周围疼痛。如果出现肛门周围的疼痛，同时伴有小腹疼痛，这时要高度怀疑直肠病变。