肺部真菌病常见的确诊方法如下：1、细菌学诊断：指从肺部取出的标本或痰中，可以直接培养出致病菌或肺部标本、痰标本的涂片中可以发现菌丝、孢子，两种方式都可以对肺部真菌病进行确诊；2、病理学诊断：指通过气管镜或经皮肺穿刺取出的肺内标本后，将其做成病理切片，可以观察到真菌感染比较明显特征或可以观察到菌丝，也可以确诊为肺部真菌病；3、逆诊：通过患者的胸片、CT等影像学诊断，根据医生的临床经验可能是真菌感染且临床症状与真菌感染的症状相似，此时通过做G试验、GM试验和痰涂片培养，有一项符合肺部真菌病的诊断标准，也可以确诊为肺部真菌病；4、其他诊断：如果以上诊断无法确诊，可以通过咳出的痰培养出的真菌或咳出的痰，经过涂片发现有孢子和菌丝。同时GM试验是阳性或IgG真菌的抗体强阳性，也可以诊断为肺部真菌病，但属于间接的诊断。