试管婴儿进行胚胎移植，但是胚胎不着床，主要原因包括胚胎原因、子宫内膜原因，还有内分泌原因，具体如下：1、胚胎原因：常见的是胚胎质量差，或者因为只是实验室工作人员进行形态学评分，看不出来是不是存在染色体异常。所以评分评出来的优质胚胎或可利用胚胎，不一定是一个完全正常的核型胚胎。如果存在染色体问题，本身就不能进行种植或进一步生长；2、子宫内膜原因：如果从女性的子宫内膜情况，子宫内膜如种地时的土壤，如果子宫内膜厚度偏薄或子宫内膜形态不好，也可能会影响胚胎种植。即使是好胚胎，没有遇到好的内膜也会影响种植和着床。还有一些女性子宫内膜厚度通过B超检查还可以，且形态看着也可以，但是存在慢性子宫内膜炎。只能通过做宫腔镜，取部分子宫内膜进行活检以明确诊断；3、内分泌原因：还有就是女性内分泌情况不适合当时进行移植，或者是对胚胎排斥，可能会造成反复种植失败。