扁桃体发炎引起头疼，在临床上较为常见，主要原因具体如下：1、可能为细菌感染后毒素吸收，反射性引起头疼；2、另外扁桃体发炎的患者，尤其为急性炎症，会导致发热，从而引起头疼。扁桃体发炎在临床上，分为急性扁桃体炎和慢性扁桃体炎。急性扁桃体炎，常因细菌感染而导致，常见的细菌为乙型溶血性链球菌及葡萄球菌，感染后患者会出现咽痛，吞咽时疼痛加剧，还有发热、周身乏力、精神食欲差等症状。检查可以发现扁桃体急性充血、水肿，严重的情况会出现脓性分泌物。治疗上首选头孢类抗生素，配合局部漱口，以缓解全身中毒症状。慢性扁桃体炎，多因机体免疫力下降，急性扁桃体炎反复发作而导致，患者平时症状较轻微，有轻微的咽干、咽部不适、咽痛、异物感、咳痰等症状。检查可以发现扁桃体慢性充血，舌腭弓黏膜增生、肥厚，与扁桃体组织粘连。治疗上以生理盐水漱口，或者咽喉部理疗、银黄含化、华素片含化等局部治疗，临床效果良好。如慢性扁桃体炎引起全身并发症，为手术摘除的指征。