肛门疼痛的药物根据肛门疼痛原因，不同的疾病进行不同的用药，主要有以下几种：一、肛窦炎：肛门疼痛是由肛窦炎引起，可以用消炎止痛栓或痔疮膏；二、肛裂：若由肛裂引起的肛门疼痛，此时需减轻引起肛裂的原因，如便秘需纠正便秘，还可使用痔疮膏或肛安软膏止疼；三、肛周病变：若由肛门口周围的其他病变引起的疼痛，如血栓性外痔、炎性外痔、内痔嵌顿引起的疼痛，需根据不同的痔疮类型进行治疗，1、血栓性外痔，需吃地奥司明减轻水肿。若口服无效，需做手术治疗。2、若为内痔嵌顿，也需进行还纳且口服地奥司明，如疗效不佳建议去结直肠肛门外科或肛肠外科门诊做相应的处理。