无痛肠镜的麻醉是采用全身麻醉，通过静脉点滴给药，检查过程中需保持轻中度的镇静，同时呼吸不受影响，可以保留患者的自主呼吸。基本上麻醉药的持续时间长短，会根据肠镜的时间长短来决定。如果肠镜时间长，麻醉药的药量会相应增多，最终的目的是保证病人在整个肠镜检查过程中，保持一种镇静状态，没有任何知觉、没有任何痛苦，同时等检查结束，能够很快从麻醉状态下恢复。以上是无痛肠镜诊疗或者是麻醉操作的流程，病人不用担心，到手术室、内镜室，通过静脉点滴给药。检查过程中全程无知觉，医生呼叫睁眼时，检查已经基本结束，不会出现病人突然术中清醒，或者检查过程中清醒的情况，同时伴有痛苦的经历。除非是肠镜检查不顺利，需要病人自己去摆某一个特殊体位，医生会停药让病人清醒过来，配合医生做相应的体位变化，以保证肠镜顺利进行和操作。排除此类特殊情况，无痛肠镜过程中始终会保证病人全程在轻中度镇静的情况下，进行检查和操作，同时进行一些病理的钳取。