临床上清洗眼睛常见于手术前的术前准备，通过0.9%的生理盐水清洗结膜囊，可获得较洁净的手术区域，使用含人工泪液的眼药水同样能达到清洁眼表的作用。如果眼睛有较多小的杂质进入，通过清洗眼睛，可以将脏东西冲刷出去。遇到酸、碱等化学伤时，清洗眼睛可降低溶剂浓度，减少对眼表的伤害。但正常情况下不推荐使用清洁液清洗眼睛，因为正常情况下结膜囊有泪液，而泪液本身就有自洁作用，可以保证眼内处于较清洁状态。此时用清洁液进行清洗，会破坏眼表稳定状态，使泪膜功能受到影响，导致干眼症状。