绝大部分卵巢囊肿手术后并不影响生育。因为卵巢囊肿在临床上采用的手术方式，通常是将囊肿单纯给予剔除而保留卵巢组织，只要保留了卵巢组织，卵巢仍然会周期性地分泌雌激素和孕激素，并且并不影响排卵，所以往往不会对生育造成影响。但如果是巧克力囊肿，在术后有可能会出现复发，一旦复发，就可能会影响生育，并不是手术本身影响生育，而是疾病导致的不孕。因此，如果是巧克力囊肿，有计划怀孕，建议在手术之后尽快考虑怀孕，否则一旦出现复发，不仅会导致进行性加重的痛经，还会对生育造成影响。此外，也建议卵巢囊肿手术后的病人，一定要给予适当休息，加强营养，才能使身体尽快康复。巧克力囊肿的病人建议在手术之后，最好少吃含有雌性激素的食物，比如豆浆、黄豆制品、雪蛤、蜂王浆等。