幽门螺杆菌总治不好，可能与感染细菌的耐药性有关，即感染的细菌可能是耐药菌，需要调整治疗方案，常从以下方面入手：1、抑酸剂的选择：需要了解既往所使用抑酸药物的情况，尽量要选择作用比较强、抑酸作用比较持久、快速的药物，以及受个体基因状态影响比较小的药物，比如雷贝拉唑、艾司奥美拉唑，以及钾通道的阻滞剂沃克，即伏诺拉生等，受个体影响相对比较小，而且抑酸作用比较强；2、抗菌素选择：根据当地抗菌素耐药情况的数据进行选择，目前第一是阿莫西林，耐药率相对比较低，还有呋喃唑酮以及四环素，耐药率的发生相对比较低，可以选择上述药物进行组合；3、规范服药：如是否规范服药，以及依从性是不是很好，均需要进行改进，包括剂量以及服药时间，均要按照医嘱执行，每次治疗的时间不能少于2周。经过上述治疗后，如果幽门螺杆菌还是不能够治好，便需要进行幽门螺杆菌耐药的监测。可以做幽门螺杆菌的细菌培养，根据细菌培养再进行药敏的实验，挑选出能够对幽门螺杆菌具有较强杀灭作用的药物进行组合，同样是提高幽门螺杆菌治疗效果的途径。