女性小便时合并有小腹痛，最常见的原因包括泌尿系统感染性疾病、泌尿系统结石疾病以及其他疾病，具体如下：1、泌尿系统感染性疾病：如尿道炎、膀胱炎或肾盂肾炎等，在排尿时可能存在尿频、尿急，同时伴有尿痛。尿痛包括尿道疼、下腹痛以及向腹部放射痛；2、泌尿系统结石疾病：如膀胱结石等，若堵在膀胱出口，即尿道内口处，则小便可存在费劲和小腹疼痛的表现；3、其他疾病：如间质性膀胱炎、膀胱疼痛综合征、盆腔疼痛综合征等可出现小便时下腹痛的表现。