因为囊胚体积较小，排出后肉眼看不到，无论是否种植成功，在天数当中均无特殊临床表现能代表，可能有少部分女性种植成功有轻微下腹部疼痛，但未出现下腹部疼痛并不代表胚胎着床失败。所以女性囊胚不着床，胚胎在宫腔内退化之后无分泌物增多或出血等表现，通常与正常未进行胚胎种植的女性将来月经前2周表现相同。如果进行囊胚移植，在胚胎移植进去之后，部分胚胎在当天即开始进行定位、粘附和种植，部分胚胎在宫腔当中可能还会继续游走1-2天时间才开始进行定位、粘附和着床。如果胚胎进去之后滋养层细胞未在子宫内膜某一个位置进行种植，胚胎则不再继续发育，基本开始退化，退化之后随子宫内膜当中腺体分泌的液体同时排出到子宫颈外口及阴道当中。