牙龈根部长了个肉疙瘩，要根据疾病的不同原因，制定不同的治疗方案。1、根尖周的病变：在临床上，最常见的原因就是根尖周病变，比如根尖周脓肿，从而穿破牙槽骨骨膜，形成的牙龈根部形成的瘘管。这种情况下往往需要做标准的牙神经的治疗，必要的时候做瘘管的刮治术，可以起到非常好的治疗效果；2、牙龈增生性疾病：比如牙龈瘤，在临床上往往需要由口腔外科医生根据具体的情况，将局部的增生物进行切除，并且对局部的牙齿、牙周膜以及牙槽骨进行有效地处理，才能得到有效的治疗，防止其复发；3、颌骨内的囊肿或肿瘤：牙根部肉疙瘩样的结构，在临床上，还要警惕发生在颌骨内的囊肿或者肿瘤性疾病，这些囊肿和肿瘤性的疾病穿破牙槽骨、骨膜以及牙龈之后，也会在牙龈的区域形成肿物样的结构。因此，在临床上，需要由专科医生进行认真鉴别；4、牙龈上的肿瘤：除了上述原因之外，还见于发生在牙龈上的肿瘤或者恶性肿瘤。牙龈出现增生样的结构，在临床上，应该引起高度警惕，尽快找专科医生进行就诊鉴别，以免误诊导致严重的后果。