肾盂肾炎属于感染性疾病，需给予适当的抗感染治疗。多数肾盂肾炎是由于逆行感染所致，大肠杆菌为较常见的致病菌，应选择针对杆菌的药物，如喹诺酮类药物，目前有新一代的喹诺酮类药物可以应用。若患者由于全身疾病导致免疫功能下降，为血源性感染，建议根据药敏结果进行尿培养，选择有效的抗菌药物。在治疗疗程上，通常急性肾盂肾炎的抗感染治疗最少需2周，之后根据病情再决定口服抗菌素或其它建议，根据实际的情况和病情控制，必要时反复进行尿培养，检测是否有细菌生长以及是否彻底治愈。若急性肾盂肾炎未得到有效控制，会慢性迁延、反反复复发作，最后发展为慢性肾盂肾炎，可引起肾脏实质受损，影响肾脏功能，出现血肌酐升高，最终走向尿毒症。