射精时疼痛通常为前列腺炎或精囊炎所致，若为射精后疼痛则无需担心，可能由于局部肌肉劳累所致。如果患者在射精时疼痛则与射精部位有关，如果存在精囊炎症，由于在射精时精囊需要挤压、收缩才可将精液挤出，而在挤压过程中会让精囊受到进一步刺激，进而出现疼痛症状。此外，在精液射出过程中必然要冲刷部分前列腺，如果前列腺存在炎症，在精液流过的过程对前列腺冲刷也会产生一定刺激。理论而言，规律排精对于缓解精囊炎和前列腺炎有益处，但在精液排出过程中，也会由于刺激而造成局部疼痛、不适。当射精时发生疼痛通常均发生在盆腔深处即会阴部，该疼痛是精囊或前列腺发生炎症而引起。虽然不建议单纯因为疼痛而抵触性生活或抵触排精，但发生该疼痛时需要到医院进行规范检查和治疗，而规律排精对于缓解精囊炎症和前列腺炎也有好处。随着治疗后病情好转，在排精过程会发现疼痛逐渐减轻。