脑脊液NGS是英文缩写，全称是Next Generation Sequencing，是指新一代的高通测序技术。脑脊液NGS检测是针对脑脊液进行高通测序，确定是否存在感染的病原体，以及通过此类方法来排除感染性病原体，诊断非感染性疾病。神经系统有部分疾病和感染有关，如病毒性脑膜炎、病毒性脑炎、细菌性脑膜炎，以及结核、霉菌及其他少见的病毒、细菌感染等，包括寄生虫感染，也有相关的抗原、抗体或者核酸。NGS是核酸检测的一种方法，如新型冠状病毒，用核酸检查方法可以进行诊断。对于脑脊液，也可以通过脑脊液的测序发现滴度非常低的核酸存在，从而判断是否存在感染性的病原体。但此过程非常敏感，有时皮肤代谢性细菌也可以被发现。此时会结合数据库来鉴定是否是背景细菌感染，即正常细菌的污染，或者是特异性的细菌感染，如感染性的病原体、结核杆菌等。脑脊液NGS检测实际上有时候可以出现假阳性，就是上述原因。同时可以出现假阴性，如脑脊液保存不当，或者脑脊液采集有问题、感染菌滴度较低，也可以因为假阴性的存在而无法确定。