子宫内膜异位症二期的治疗方法要看其引起病损的情况，如果有卵巢大于5公分的肿瘤，同时需要马上怀孕，则可以进行腹腔镜手术，并且根据腹腔镜手术术中所见来进一步进行分期，术后可以根据情况选择药物的辅助治疗方法。通常子宫内膜异位症是一种困扰女性的慢性疾病，其不仅可出现继发痛经进行性加重，而且可反复复发，同时还会造成不孕等情况。出现了子宫内膜异位症必须选择正确的治疗方法，否则治疗起来非常困难，而且容易导致卵巢功能早衰的现象。如果近期内打算要小孩，在治疗后应该马上怀孕。如果近期没有要孩子的准备，可在一般治疗后继续服用短效口服避孕药来防止复发。