小拇指关节肿痛的主要原因如下：1、滑膜炎症：由于关节频繁活动，引起关节滑膜增生或者增厚，出现滑膜炎症状。如果发生在关节部位，患者可以出现腱鞘炎症或者腱鞘水肿；2、特殊性滑膜炎症：如由于痛风疾病而导致关节痛风石沉积，表现为关节肿痛。另外，类风湿性疾病引起关节类风湿性病变，出现类风湿性滑膜炎时，患者可表现为红、肿、热、痛症状；3、其他因素：占位性病变或者感染性病变引起，对于占位性病变比如囊肿，由于挤压关节内空间，会出现活动以后肿痛。感染性疾病是由于细菌性感染，出现局部红、肿、热、痛情况。所以针对不同症状，需要具体分析，并找出病因进行对症治疗。