肝癌的肿瘤标志物包括甲胎蛋白、CA19-9、癌胚抗原等，不同来源的肿瘤标志物存在较大差别，需进行选择，具体如下：1、肝脏来源：可分为原发性肝癌和转移性肝癌，原发性肝癌指肿瘤细胞来自于肝脏本身，包括肝细胞肝癌和肝内胆管癌，肝细胞肝癌的肿瘤标志物主要指甲胎蛋白水平，而肝内胆管癌肿瘤标志物异常升高的是CA19-9；2、结直肠来源：发生肝转移引起的肝癌，肿瘤标志物主要是CEA即癌胚抗原；3、其他来源：胰腺来源的肿瘤主要是以CA19-9为主，卵巢来源的肿瘤可能会出现CA12-5的异常升高，而胃癌肝转移会出现CA72-4的异常升高，以及肺癌、乳腺癌、甲状腺癌等，这些恶性肿瘤分别有自己的肿瘤标志物。