久坐肛门疼痛，需要针对具体情况治疗，主要分以下几种情况：1、肛门疾病：久坐容易造成痔疮、肛裂，甚至肛周脓肿。如果有痔疮，就需要针对痔疮进行治疗，用一些痔疮膏，口服痔疮药进行治疗。如果有肛裂，也是要用痔疮膏、止痛膏进行治疗。还有肛周脓肿，肛周脓肿疼痛比较剧烈，持续性的疼痛，肛周周围可能还有硬块，摸起来疼痛，皮肤温度增高，一般需要手术治疗加抗感染治疗。常见的，影响肛门周围疼痛的疾病就是这几种疾病。如果痔疮和肛裂经过用药治疗不好，可能就需要手术治疗；2、自主神经功能紊乱：不是这些疾病引起，可能是久坐引起肛门周围的自主神经功能紊乱所引起的疼痛。需要尽可能的少坐，可以多喝水、多运动，另外可以肛门用温水坐浴。如果能泡温泉是最好，可以弄个盆子弄半盆温水，里面加点食盐，屁股坐在这边泡。还有就是淋浴的时候，用热水这种淋浴头，对着肛门用热水来进行冲洗，持续冲洗几分钟，这样一般都会缓解疼痛。