小儿室间隔增厚可以手术治疗，但多数情况下，室间隔增厚无需手术。因为室间隔增厚对于儿童较为常见，引起小儿室间隔增厚的常见原因为小儿心肌炎，所以小儿室间隔肥厚无需手术治疗，患儿注意休息，并给予营养心肌的药物，促进炎症恢复、水肿消退，即可达到治疗目的。需手术治疗的小儿室间隔肥厚多指肥厚型心肌病，且为梗阻性肥厚型心肌病。因肥厚性梗阻型心肌病如不进行手术会造成血液无法达到机体，导致患儿晕厥、心律失常，甚至猝死，此时可考虑手术治疗，如介入消融治疗、开胸手术等，但极为罕见、因为小儿肥厚心肌病发生率较低，而梗阻性肥厚性心肌病发生率则更低，因此小儿室间隔增厚进行手术的几率非常低，多为一过性增厚，由于炎症及水肿所导致。小儿室间隔增厚可以手术，但多数患儿无手术指征，仅需内科治疗即可恢复。