月经期间建议不要做肠镜，因为在解剖结构上女性阴道和直肠肛门位置非常近，而做肠镜时会有粪水随着肠镜进出而经肛门流出，会经阴道逆行感染到子宫。月经期间子宫内膜脱落，会有很多的血管断端及创面，此时做肠镜容易因为逆行感染而导致宫腔感染，甚至会有炎症入血，造成女性生殖器官的炎症反应。因此，月经期不推荐做肠镜，最好等月经期完全结束以后，即子宫内膜完全修复、平整，没有创面、血管断端，此时再做肠镜会相对安全。