HPV转阴后同房，有转阳再感染的机会，因HPV主要传播途径是性生活感染，还有其它途径，如公共区使用马桶等传播方式。HPV转阴可能是病毒彻底消除，也可能是病毒低量复制，有较少的病毒量，但目前检测方法检测不出，如果有性生活，可以重新感染，此时可以感染与以前一样的型别，也可以感染不一样的型别。HPV转阴可能是病毒处于低量复制状态，当身体抵抗力较强后，低量复制一直被压制，但抵抗力较弱后，病毒复制越来越多，从阴性状态变成阳性状态。由于HPV主要传播方式是性生活感染，因此HPV转阴后仍可通过同房再感染。