肛门肿胀、疼痛需要根据不同病因进行相应治疗，常见病因如下：1、痔核嵌顿：肛门周围有较大的痔核，嵌顿在肛门会有肿胀、疼痛感。需要就诊结直肠肛门外科或者肛肠外科后，尝试嵌顿痔核的还纳，还纳后应用减轻水肿的药物，必要时进行手术治疗；2、肛周脓肿：如果患有肛周脓肿，周围有包块，触摸有疼痛感，皮肤温度增高，需要手术治疗，可就诊结直肠肛门外科，或者肛肠外科进行治疗；3、血栓性外痔：如果患有血栓性外痔，肛门周围有紫黑色硬块，疼痛比较剧烈，需要手术治疗；4、炎性外痔：如果患有炎性外痔，需要手术治疗。如果肛门周围没有疾病，就诊结肠肛门外科，检查排除疾病因素后有可能是由精神心理因素引起，应注意休息、减轻焦虑、减轻抑郁、多运动，转移注意力。